Kê khai nộp thuế môn bài cho địa điểm kinh doanh khác tỉnh

Về các vướng mắc của bạn, Công ty Luật Việt An xin tư vấn như sau:

Về phân công cơ quan thuế quản lý

Theo Công văn 3200/TCT-KK của Tổng cục Thuế và Quyết định 381/QĐ-BTC ngày 26/02/2025 của Bộ Tài chính, việc quản lý thuế đối với các địa điểm kinh doanh khác tỉnh được thực hiện dựa trên nhiệm vụ thu ngân sách và tình hình thực tế tại địa phương. Cụ thể:

• Chi cục Thuế nơi doanh nghiệp đặt trụ sở chính, trong trường hợp này là Chi cục Thuế khu vực I (đặt tại Hà Nội, quản lý toàn bộ địa bàn Hà Nội, trước đây là Cục Thuế Hà Nội), có trách nhiệm phân công cơ quan thuế quản lý đối với địa điểm kinh doanh tại tỉnh, thành phố khác (ở đây là Chi cục Thuế khu vực II, quản lý TP. Hồ Chí Minh, đặt tại TP. Thủ Đức);
• Việc phân công dựa trên thông tin đăng ký của địa điểm kinh doanh trong Danh sách địa điểm kinh doanh do doanh nghiệp cung cấp hoặc chi nhánh chủ quản (nếu có) cập nhật trên hệ thống quản lý thuế (TMS);
• Sau khi phân công, Chi cục Thuế khu vực I sẽ thông báo bằng văn bản đến Chi cục Thuế khu vực II để thực hiện quản lý thuế theo quy định. 

Quy trình này nhằm đảm bảo tính minh bạch và thống nhất trong quản lý thuế, tránh tình trạng doanh nghiệp phải làm việc với nhiều cơ quan thuế khác nhau mà không có sự phối hợp rõ ràng.

Về đăng ký thuế

Chi cục Thuế khu vực II (quản lý địa điểm kinh doanh tại Quận 4, TP. Hồ Chí Minh) sẽ:

• Chi cục Thuế khu vực II (quản lý địa điểm kinh doanh tại Quận 4, TP. Hồ Chí Minh) sẽ;
• Cấp mã số thuế 13 số cho địa điểm kinh doanh tại Quận 4;
• Gửi thông báo mã số thuế (theo mẫu 11-MST) đến đơn vị chủ quản (công ty tại Hà Nội) và địa điểm kinh doanh tại TP. Hồ Chí Minh để sử dụng trong việc kê khai và nộp thuế. 

Lưu ý: Mã số thuế 13 số này chỉ phục vụ mục đích quản lý thuế và không liên thông với hệ thống đăng ký kinh doanh của Sở Kế hoạch và Đầu tư. Điều này khác với mã số thuế 10 số của doanh nghiệp chính, vốn được sử dụng đồng thời trong đăng ký kinh doanh và quản lý thuế. 

Khi có sự thay đổi thông tin (ví dụ: thay đổi địa chỉ, tạm ngừng kinh doanh, hoặc chấm dứt hoạt động), Chi cục Thuế khu vực II sẽ:

• Cập nhật thông tin vào hệ thống TMS dựa trên dữ liệu từ cơ quan đăng ký kinh doanh truyền sang;
• Điều chỉnh thông tin mã số thuế 13 số tương ứng để tiếp tục quản lý theo quy định hiện hành.

Quy trình kê khai và nộp thuế môn bài

Sau khi địa điểm kinh doanh tại Quận 4 được cấp mã số thuế 13 số, công ty bạn cần thực hiện các bước sau để kê khai và nộp thuế môn bài:

• Lập tờ khai lệ phí môn bài: Sử dụng mẫu được quy định tại Phụ lục ban hành kèm Thông tư 86/2024/TT-BTC quy định về đăng ký thuế do Bộ trưởng Bộ Tài chính ban hành;
• Nộp tờ khai: Tờ khai được nộp trực tiếp tại Chi cục Thuế khu vực II (63 Vũ Tông Phan, phường An Phú, TP. Thủ Đức, TP. Hồ Chí Minh) hoặc thông qua hệ thống thuế điện tử (eTax) nếu công ty đã áp dụng phương thức này;
• Nộp lệ phí môn bài: Số tiền lệ phí môn bài được xác định dựa trên vốn đăng ký của địa điểm kinh doanh (theo Điều 4 Nghị định 139/2016/NĐ-CP, sửa đổi bởi Nghị định 22/2020/NĐ-CP), cụ thể:
  • Vốn trên 10 tỷ đồng: 3.000.000 VNĐ/năm;
  • Vốn từ 10 tỷ đồng trở xuống: 2.000.000 VNĐ/năm;
  • Địa điểm kinh doanh không có vốn đăng ký riêng: áp dụng mức 1.000.000 VNĐ/năm.

Thời hạn nộp: Lệ phí môn bài phải được nộp chậm nhất vào ngày 30/1 của năm sau năm thành lập địa điểm kinh doanh. Tuy nhiên, vì địa điểm kinh doanh của bạn được thành lập từ tháng 8/2019, bạn cần kiểm tra xem đã nộp lệ phí môn bài cho các năm trước (2020-2024) hay chưa để tránh bị phạt chậm nộp. Các hình thức nộp lệ phí môn bài bao gồm:

• Nộp trực tiếp: Nộp tiền mặt hoặc chuyển khoản tại Kho bạc Nhà nước theo tài khoản của Chi cục Thuế khu vực II.
• Nộp qua ngân hàng: Sử dụng dịch vụ ngân hàng (ví dụ: Vietcombank, BIDV) để chuyển khoản lệ phí môn bài vào tài khoản của cơ quan thuế.
• Nộp qua hệ thống eTax: Thanh toán trực tuyến bằng tài khoản ngân hàng liên kết với cổng thông tin thuế điện tử (thuedientu.gdt.gov.vn) sau khi nộp tờ khai điện tử.

Các lưu ý quan trọng khi thực hiện kê khai nộp thuế môn bài cho địa điểm kinh doanh khác tỉnh

Trách nhiệm của doanh nghiệp

• Doanh nghiệp cần cập nhật đầy đủ thông tin về địa điểm kinh doanh vào hệ thống đăng ký kinh doanh (theo Điều 33 Nghị định 01/2021/NĐ-CP) để cơ quan thuế có cơ sở phân công và cấp mã số thuế;
• Nếu địa điểm kinh doanh không được đăng ký đúng quy định, doanh nghiệp có thể bị xử phạt hành chính theo Điều 8 Nghị định 125/2020/NĐ-CP (mức phạt từ 1.000.000 VNĐ đến 10.000.000 VNĐ tùy trường hợp).

Phối hợp giữa các cơ quan thuế

• Chi cục Thuế khu vực I và Chi cục Thuế khu vực II sẽ phối hợp qua hệ thống TMS để đảm bảo thông tin thuế của địa điểm kinh doanh được đồng bộ;
• Trường hợp có sai sót trong phân công hoặc cấp mã số thuế, doanh nghiệp cần liên hệ Chi cục Thuế khu vực I để được điều chỉnh kịp thời.

Hình thức nộp thuế hiện đại hóa

Tính đến năm 2025, Tổng cục Thuế đã triển khai rộng rãi hệ thống thuế điện tử (eTax), cho phép doanh nghiệp nộp tờ khai và lệ phí môn bài trực tuyến mà không cần đến trực tiếp cơ quan thuế. Để sử dụng dịch vụ này, công ty bạn cần:

• Đăng ký tài khoản giao dịch thuế điện tử với Chi cục Thuế khu vực II;
• Ký số điện tử trên tờ khai mẫu 01/MBAI và nộp qua cổng thông tin thuế điện tử (thuedientu.gdt.gov.vn);
• Thanh toán lệ phí qua tài khoản ngân hàng liên kết với hệ thống eTax.

Kết luận: Với trường hợp của công ty bạn – có trụ sở chính tại Hà Nội và địa điểm kinh doanh tại Quận 4, TP. Hồ Chí Minh thành lập từ tháng 8/2019 – việc kê khai và nộp thuế môn bài cần được thực hiện đầy đủ để đảm bảo tuân thủ pháp luật. Đến tháng 4/2025, sau hơn 5 năm hoạt động, bạn nên liên hệ Chi cục Thuế khu vực II (63 Vũ Tông Phan, TP. Thủ Đức) để kiểm tra xem địa điểm kinh doanh đã được cấp mã số thuế 13 số và nộp lệ phí môn bài cho các năm trước (2020-2024) hay chưa; nếu chưa, cần lập tờ khai mẫu 01/MBAI, nộp bổ sung lệ phí (thường là 1.000.000 VNĐ/năm) và xử lý phạt chậm nộp (nếu có) trước ngày 30/1/2026 cho năm hiện hành, nhằm tránh rủi ro pháp lý và tối ưu hóa hoạt động kinh doanh.

Dịch vụ hỗ trợ kê khai nộp thuế môn bài cho địa điểm kinh doanh khác tỉnh của Luật Việt An

Hiểu được những khó khăn mà doanh nghiệp gặp phải khi kê khai và nộp thuế môn bài cho các địa điểm kinh doanh khác tỉnh, Công ty Luật Việt An cung cấp dịch vụ trọn gói nhằm hỗ trợ quý khách hàng tối ưu hóa quy trình và đảm bảo tuân thủ pháp luật. Cụ thể, chúng tôi:

• Kiểm tra tình trạng thuế: Xác minh thông tin mã số thuế 13 số và tình hình nộp lệ phí môn bài của địa điểm kinh doanh tại cơ quan thuế quản lý;
• Soạn thảo hồ sơ: Chuẩn bị tờ khai theo mẫu của Thông tư mới (Thông tư số 86/2024/TT-BTC thay thế Thông tư 105/2020/TT-BTC) cùng các tài liệu liên quan;
• Đại diện nộp thuế: Thay mặt doanh nghiệp nộp tờ khai và lệ phí môn bài tại Chi cục Thuế khu vực II (trực tiếp hoặc qua hệ thống eTax), đảm bảo đúng thời hạn trước ngày 30/1 hàng năm;
• Tư vấn xử lý vi phạm: Hỗ trợ giải quyết các trường hợp chậm nộp hoặc sai sót từ các năm trước, bao gồm tính toán tiền phạt và lập kế hoạch khắc phục;
• Theo dõi và cập nhật: Đồng hành cùng doanh nghiệp trong việc cập nhật thông tin thay đổi của địa điểm kinh doanh trên hệ thống TMS và đăng ký kinh doanh. 

Trên đây là những nội dung tư vấn chi tiết liên quan đến câu hỏi của bạn về kê khai nộp thuế môn bài cho địa điểm kinh doanh khác tỉnh. Bạn vui lòng tham khảo và đừng ngần ngại liên hệ Công ty Luật Việt An nếu cần thêm sự hỗ trợ hoặc giải đáp các vướng mắc khác!